Bei der Havarie wurde ein großes Gebiet des Riffs beschädigt. Angelique Sorgco, Managerin des Tubbataha-Parks hatte gehofft, dass Schaden kleiner ausfallen würde, wie die österreichische Zeitung der Standard berichtet. Die Langzeitfolgen für das sensible Ökosystem sind noch nicht absehbar. Dennoch werde der Nationalpark nicht mehr Schadensersatz verlangen, wie die philippinischen Behörden vorschreiben: 600 Dollar für einen beschädigten Quadratmeter Korallenriff. „Mit den 1,4 Millionen Dollar kommen sie mit einem blauen Auge davon“, sagte Songco.

Das Kriegsschiff musste in mehrere Teile zerlegt werden, um weitere Schäden am Riff zu vermeiden. Die Kosten für die Bergung werden auf knapp 45 Millionen Dollar geschätzt, so Songco.

Wie die „USS Guardian“ überhaupt auf das Korallenriff laufen konnte, ist noch immer nicht geklärt. Da streiten sich die Parteien. Die philippinische Küstenwache behauptet, die Crew des Kriegsschiffes habe mehrere Warnungen einfach ignoriert. Diese wiederum schiebt die Schuld auf ungenaue Navigationskarten.